生物食品與環(huán)境學(xué)院共設(shè)置教學(xué)及科研實驗室65間，（含53號樓生物增材安徽省教育廳重點實驗室和43號樓環(huán)境研究院實驗室）,，現(xiàn)有3個省級實驗室（實訓(xùn)中心）：污水凈化與生態(tài)修復(fù)材料實驗實訓(xùn)中心,，生物工程與技術(shù)虛擬仿真實驗教學(xué)中心,，發(fā)酵工程及應(yīng)用實訓(xùn)（實驗）中心和2個院級重點實驗室：發(fā)酵工藝開發(fā)與應(yīng)用實驗室和應(yīng)用酶學(xué)與工程實驗室,。34號樓一樓主要為工程類實驗室：發(fā)酵工程實驗室,、固廢處理工程實驗室,、水處理工程實驗室,、啤酒生產(chǎn)實訓(xùn)中心,、四大名點實驗室等實驗室,；四樓主要為公共平臺實驗室（如培養(yǎng)室、滅菌室,、菌種室等）和專業(yè)實驗室（基因工程實驗室,、食品生物技術(shù)實驗室、酶工程實驗室等）以及連廊上的分析測試實驗室,；五樓為環(huán)境工程專業(yè)實驗室和食品類專業(yè)實驗室以及教師科研平臺和分析測試室等,。總使用面積約6000m2,。承擔(dān)生物食品與環(huán)境學(xué)院生物工程,、環(huán)境工程,、食品科學(xué)與工程、食品質(zhì)量與安全本科專業(yè)的專業(yè)基礎(chǔ)和專業(yè)實驗課程,，并為大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè),、挑戰(zhàn)杯、第二課堂等提供支持,。實驗室擁有原子分光光度計,、高效液相-質(zhì)譜聯(lián)用儀、氣相色譜儀,、TOC測定儀,、元素分析儀、紅外分光光度計,、高效液相色譜儀,、蛋白質(zhì)純化儀等精密儀器及一般儀器5000多臺套，儀器總價值近8000萬元,。實驗室擁有專職管理人員12人,，其中高級實驗師4人。另有教師兼職管理人員13人,。
實驗中心還承擔(dān)全院研究生實驗教學(xué)任務(wù),，300余本科碩士生畢業(yè)論文及全院教師的教科研任務(wù)。
實驗室先后承擔(dān)了國家自然科學(xué)基金項目,；中國科學(xué)院海洋實驗生物開放實驗室研究項目,；國家863項目子課題；國家水專項子課題,；安徽省科技廳自然科學(xué)基金項目,，安徽省科技廳攻關(guān)項目；安徽省教育廳自然科學(xué)項目,。獲安徽省教育廳科技進(jìn)步獎,，安徽省自然科學(xué)獎，安徽省教育廳優(yōu)秀科技成果等多項獎項,。